遭到逆藏嘲讽的日向，决定不惜一切代价追求“能够和七海站在一起”的才能，因此毅然选择接受“希望育成计划”实验。可惜实验失败，原日向创的精神并未被完全抹消，而是分裂为神座出流和日向创两个人格。作为神座出流的人格成为了各种超高校级能力集于一身、并且失去了一切感情和兴趣的失控怪物，作为日向创的隐人格则将记忆永远停留在与七海初遇的时刻，该时空被冻结不再继续运转。
由于隐人格日向创一直在沉睡状态，所以校方并未发现实验的失败。神座出流随后被江之岛盾子引诱，开始对追求绝望产生兴趣并成为“超高校级的绝望”核心成员。在“人类史上最大最恶的绝望事件”中协助江之岛盾子的计划虐杀七海千秋，在其死亡时体内的日向创人格却突然暴走，干涉神座出流使其变得更加扭曲，获得了名为“绝望”的可怕情感。处于绝望下的神座出流决定建造巨大的核融合炉毁灭这个已经没有了七海千秋的世界。在核融合炉完成后却被未来机关将自己与其他绝望残党一同送入贾巴沃克岛，开始执行“希望更生程序”。陷入绝望的神座出流决定破坏未来机关的计划，因此将江之岛盾子的Alter Ego实装入程序。但在陷入沉眠后，在虚拟人格日向创和同学们的相处中，对往日美好记忆的向往渐渐复苏，日向创其人也爱上了七海千秋。对七海千秋的爱导致原日向创的隐人格再次暴走，使神座出流分化为神座人格和“超高校级的未来·日向创”人格。拥有“超高校级的未来”才能的日向创也同时拥有原日向创和神座出流的全部记忆，当真正的日向创从绝望的情绪中苏醒、发现自己已经害死了真正的七海千秋、并且还想用核融合炉炸毁世界后，主动从“希望更生程序”中脱出并决心弥补自己的过错。物体融化后是会流动的，时间也是如此，因此日向创希望通过核融合炉的爆炸使时间倒流，将时间倒回和七海分别的那个夜晚，和最初从未分裂过的日向创对话，告诉他这个世界还是很美好的，人生不仅仅有才能，创造出与他人的回忆，才会生出比才能更重要的希望……他想要告诉日向创，有人依然深爱着没有才能的他。如果日向创放弃追求才能，他就不会分化出神座出流的人格，也不会害死七海千秋或者制造融合炉，进而拯救了这个世界。
然而日向创没能如愿，时间虽然融化并开始流动，方向却是从日向创与七海初遇的时间点流动到现在，因此拥有才能的日向创见到了作为预备学科学生的普通人日向创。日向创明白即使现在告诫原来的自己不要追求才能，过去也不会被改变，因为过去的自己来到了不属于他的时空，与此同时以往的事情依然不可逆转地发生了。于是他选择杀死原来的自己，最初的日向创死去，神座出流和自己的人格都不会出现，神座出流犯下的错误也会随着自己的死亡而被抹消。最后，日向创抱着过去的自己跳入核融合炉中，爆炸在产生的一瞬间即湮灭，世界归于平静，那个名为日向创的人消失了，从过去到现在和未来，都不会再出现一丝他存在过的痕迹。
故事的末尾，七海千秋正靠在希望峰学园的校门口打着游戏。她隐约觉得自己应该在等着什么人，但是这似乎确实是错觉。陪伴她的，只有司空见惯的秋日晴空。

街明(まちあ)かり 华(はな)やか
machi akari hanayaka
街上照明 光华璀璨
エーテル麻酔(ますい) の 冷(つめ)たさ
eeteru masai no tsumetasa
乙醚麻醉 的 冰冷
眠(ねむ)れない 午前二时(ごぜんにじ)
nemure nai gozen niji
无法成眠的 凌晨两点
全(すべ)てが 急速(きゅうそく)に変(か)わる
subete ga kyuusoku ni kawaru
一切事物 快速地转变
オイル切(ぎ)れのライター
oiru gireno raita
油气用尽的打火机
焼(や)けつくような胃(い)の中(なか)
yaketsuku youna hinonaka
如熔烧般的胃袋里
全(すべ)てがそう嘘(うそ)なら
subete gasou usonara
若这些都是谎言的话
本当(ほんとう)に よかったのにね
hontou ni yokata nonine
就真的好了
君(きみ)の首(くび)を缔(し)める梦(ゆめ)を见(み)た
kimino kubiwo shimeru yumewo mita
做了个紧勒住你脖子的梦
光(ひかり)の溢(あふ)れる昼下(ひるさ)がり
hikarino afureru hirusagari
光明流泄的午后
君(きみ)の细(ほそ)い喉(のど)が跳(は)ねるのを
kimino hosoi nodoga haneru nowo
看著你纤细的颈子颤抖的模样
泣(な)き出(で)しそうな眼(め)で见(み)ていた
nakideshi souna mede mitei ta
用泫然欲泣的双眼
核融合炉(かくゆうごうろ)にさ
kakuyuugouro nisa
核融合炉啊
飞(と)び込(こ)んでみたい と思(おも)う
tobikon de mitaito omou
真想跳进去看看 脑中想著
真(ま)っ青(さお)な 光(ひかり) 包(つつ)まれて绮丽(きれい)
ma ssaona hikari tsutsumarete kirei
被青蓝色的 光 包围多么漂亮
核融合炉(かくゆうごうろ)にさ
kakuyuugouro nisa
核融合炉啊
飞(と)び込(こ)んでみたら そしたら
tobikon de mitara soshitara
跳了进去 而在那同时
すべてが许(ゆる)されるような気(き)がして
subete ga yurusareru youna kigashite
彷佛一切都得到了谅解
ベランダの向(む)こう侧(かわ)
be randa no mukougawa
阳台的对面
阶段(かいだん)を昇(のぼ)ってゆく音(おと)
dankaiwo nobotte yukuodo
顺著阶梯而上的声响
阴(かげ)り出(だ)した空(そら)が
kageri dasita soraga
逐渐转阴的天空
窓(まど)ガラスに 部屋(へや)に落(お)ちる
madoga rasuni heyani ochiru
朝著玻璃窗 朝著房间坠落
拡散(かくさん)する夕暮(ゆうぐ)れ
kakusannsuru yuugure
扩散而去的暮色
泣(な)き肿(は)らしたような阳(ひ)の赤(あか)
nakihara sita youna hinoaka
太阳的红就像哭泣时的红肿
融(と)けるように少(すこ)しずつ
tokeru youni sukoshisutsu
就像融化般一点一滴
少(すこ)しずつ死(し)んでゆく世界(せかい)
sukoshisitsu shindeyuku sekai
一步一步地死去的世界
君(きみ)の首(くび)を绞(し)める梦(ゆめ)を见(み)た
kimino kubiwo shimeru yumewo mita
做了个紧勒住你脖子的梦
春风(はるかぜ)に揺(ゆ)れるカーテン 乾(かわ)いて
harukaze ni yureru katten
随春风晃荡的窗帘
切(き)れた唇(くちびる)から
kawaite kireta kuchibiru kara
自乾裂的双唇之中
零(こぼ)れる言叶(ことば)は泡(あわ)のよう
koboreru kotoba wa awanoyou
落下的话语有如泡沫
核融合炉(かくゆうごうろ)にさ
kakuyuugouro nisa
核融合炉啊
飞(と)び込(こ)んでみたい と思(おも)う
tobikonde mitaito omou
真想跳进去看看 脑中想著
真(ま)っ白(しろ)に 记忆(きおく) 融(と)かされて消(き)える
massironi kioku tokasarete kieru
记忆 会被融成一片雪白 而消失
核融合炉(かくゆうごうろ)にさ
kakuyuugouro nisa
核融合炉啊
飞(と)び込(こ)んでみたら また昔(むかし)みたいに
tobikonde mitara mata mukasi mitaini
跳了进去 旋即又像以前一般
眠(ねむ)れるような そんな気(き)がして
nemureru youna sonna kigashite
有种彷佛 得以沉睡的感觉
时计(とけい)の秒针(びょうしん)や
tokei no byoushin ya
时钟的秒针
テレビの司会者(しかいしゃ)や
terei no shikaisha ya
电视上的主持人
そこにいるけど 见(み)えない谁(だれ)かの
sokoni irukedo mienai darekano
和就存在于那 却无法目视的某人的
笑(わら)い声(ごえ) 饱和(ほうわ)して反响(はんきょう)する
waraikoe howasite hankyo suru
笑声 产生饱合发出回音
アレグロ·アジテート
areguro ajitetto
快速而激烈
耳鸣(みみな)りが消(き)えない 止(や)まない
miminariga kienai yamanai
耳鸣既不消失 也不停止
アレグロ·アジテート
areguro ajitetto
快速而激烈
耳鸣(みみな)りが消(き)えない 止(や)まない
miminariga kienai yamanai
耳鸣既不消失 也不停止
谁(だれ)もみんな消(き)えてく梦(ゆめ)を见(み)た
daremo minna kieteku yumewo mita
做了大家一个接一个消失的梦
真夜中(まよなか)の 部屋(へや)の広(ひろ)さと静寂(せいじゃく)が
mayonakano heyano hirosato seijyakuga
午夜里 房间的宽敞与寂静
胸(むね)につっかえて
muneni tsuyukaete
对著心跳反击
上手(じょうず)に 息(いき)ができなくなる
jyouzuni ikigadeki nakunaru
渐渐地 无法顺利呼吸
(Shout!!)
核融合炉(かくゆうごうろ)にさ
kakuyuugouro nisa
核融合炉啊
飞(と)び込(こ)んでみたら そしたら
tobikonde mitara soshitara
试着跳了进去 而在那同时
きっと眠(ねむ)るように 消(き)えていけるんだ
kitto nemuru youni kieteike runda
一定能够像睡著般 消失
仆(ぼく)のいない朝(あさ)は
bokuno inai asawa
没有我的早晨
今(いま)よりずっと 素晴(すば)らしくて
imayori zutto subarasi kute
会比更加地 美好上无数倍
全(すべ)ての歯车(はくるま)が噛(か)み合(あ)った
subete no hakuruma ga kamiatta
一切的齿轮都完整地咬合
きっと そんな世界(せかい)だ
kitto sonna sekaida，a~
一定 会是那样的世界吧
ァァァァァ！
aaaaa!!!
啊啊啊啊啊！